Nomenclature Pneumocystis

Nomenclature Pneumocystis

L’article récent du Dr Francis Giglotti sur le changement de nom de Pneumocystis carinii et le commentaire éditorial des Drs Melanie Cushion et James Stringer montrent clairement les lignes d’escarmouche de cette bataille en cours concernant la nomenclature appropriée de Pneumocystis Organismes fongiques opportunistes apparentés Le genre Pneumocystis représente un groupe médicalement important de champignons apparentés qui colonisent des hôtes sains et provoquent une pneumonie létale chez les humains immunodéprimés, en particulier ceux atteints de SIDA ou de tumeurs malignes ou recevant des médicaments immunomodulateurs . le nom de la variante humaine à Pneumocystis jiroveci et l’organisme à base de rats à P carinii, une controverse considérable subsiste sur les approches appropriées pour la taxonomie de ces pathogènes opportunistes mal compris La base de la controverse provient de notre incapacité continue à cultiver avec succès Pneumocystis ou Les méthodes classiques d’isolement de l’organisme, de caractérisation biochimique des champignons, et de propagation reproductible de ces isolats, alternent Délimiter des espèces de Pneumocystis ont été proposées, largement basées sur des variations génétiques Bien que cette approche soit initialement attrayante, relativement peu de gènes ont été caractérisés pour Pneumocystis à travers plusieurs isolats de laboratoire et cliniques autres qu’une poignée de gènes dérivés d’organismes prélevés sur des rats. , en ce que le génotypage effectué sur des souches de Pneumocystis dérivées de rats représentant des colonies cultivées dans différentes institutions présente une diversité de séquence génétique considérable% -% sur des locus génétiques uniques et conservés Il reste donc impossible de déterminer clairement si ces différences génétiques la diversité parmi les souches de Pneumocystis ou Récemment, au moins des espèces ont été proposées chez l’hôte du rat Des niveaux similaires de diversité génétique ont également été observés chez des isolats humains provenant de différentes espèces. sources Ainsi, on pourrait se demander si le P jiroveci humain représente vraiment une espèce unique, telle que proposée, ou s’il peut aussi s’agir d’espèces multiples ou peut-être d’infections mixtes chez un patient donné. Des données génétiques et des moyens restreints pour manipuler expérimentalement l’organisme, nous manquons des outils appropriés pour fixer définitivement tout système de classification des espèces à travers ce genre. La spéciation rigide de Pneumocystis reste prématurée. Il est bien accepté que les organismes Pneumocystis d’une espèce hôte ne peuvent infecter même mammifères immunodéprimés d’une autre espèce Cependant, cette sélectivité exquise de l’organisme pour l’hôte a permis à de nombreux chercheurs de définir avec succès les isolats de Pneumocystis simplement en rapportant les espèces hôtes particulières dont ces organismes ont été dérivés. Je ne connais aucun Le changement de nom proposé de P carinii pour désigner spécifiquement les organismes dérivés du rat et P jiroveci pour désigner des isolats humains a soulevé une confusion considérable et peut-être inutile chez les médecins qui soignent des patients. Avec l’infection La littérature médicale persiste largement à utiliser P carinii pour se référer à cet organisme qui est associé à la pneumonie humaine. C’est Pneumocystis humain qui détient la plus grande pertinence pour la maladie naturelle chez toute espèce S’il était nécessaire de définir Pneumocystis de la dérivation humaine comme un espèce unique, il semblerait approprié Il semble probable que le débat sur la nomenclature appropriée des espèces de Pneumocystis se poursuivra La plupart des auteurs continuent à utiliser le terme pneumonie P carinii pour désigner une infection à Pneumocystis chez l’homme. années, la désignation P jiroveci n’a pas été clairement adopté par la majorité des cliniciens et des enquêteurs traitant de cette infection Parce que la controverse persiste, il semble nécessaire de reprendre la discussion et de débattre des mérites de ces différentes approches dans les forums publics, dérive vrai consensus, et seulement ensuite se déplacer, en tant que communauté, vers une nomenclature unifiée pour ce groupe intrigant de champignons opportunistes

Remerciements

Conflits d’intérêts potentiels AHL: no conflicts