Rapport de laboratoire électronique pour le médecin des maladies infectieuses et le microbiologiste clinique

Rapport de laboratoire électronique pour le médecin des maladies infectieuses et le microbiologiste clinique

Contexte Un important avantage de l’information électronique sur la santé est l’amélioration de l’interface entre la pratique des maladies infectieuses et la santé publique. Compte tenu de son mandat légal et de son importance évidente pour la santé publique, le PCEM est un premier pas important dans le tamisage et la mise en commun des données sur la santé. Au cours des prochaines années, presque tous les CDR passeront à InternetMethodsCet article passe en revue les composantes du rapport électronique de laboratoire ELR, y compris le criblage des données dans un système de gestion des informations de laboratoire pour les résultats déclarables, les vocabulaires contrôlés. Identificateurs d’observation logiques Noms et codes [Regenstrief Institute], et SNOMED, ​​nomenclature systématique de la médecine [College of American Pathologists], la «syntaxe» d’un message électronique, par exemple, niveau de santé [HL], implications de la transférabilité et de la responsabilité Agir pour ELR, et les obstacles et les potentiels avantages des résultats ELRResultats Les médecins spécialistes des maladies infectieuses, les professionnels de la lutte contre les infections et les laboratoires de microbiologie participeront au RCE électronique de plusieurs façons, y compris les rapports de cas sur le Web et la RLE, la transmission directe et automatique des rapports sur les maladies transmissibles. Le système d’information de la juridiction de santé publique appropriéeConclusionsELR peut potentiellement avoir un impact important sur la rapidité et l’exhaustivité des rapports sur les maladies transmissibles, mais ne remplace pas la responsabilité du clinicien de soumettre un rapport de cas avec des informations démographiques et épidémiologiques importantes

De plus en plus, les données médicales et de santé sont enregistrées, stockées, analysées et communiquées électroniquement. Un avantage important est l’amélioration de l’interface entre la pratique des maladies infectieuses et la santé publique. Certains médecins spécialistes des maladies infectieuses participent déjà à la santé publique. les réseaux de communications électroniques, y compris ProMED-mail, le réseau Emerging Infectious Disease, et les réseaux d’alerte santé locaux et étatiques CDR est une autre facette de la gestion électronique de l’information sur la santé. Au cours des prochaines années, presque tous les CDR se déplaceront sur Internet. Les médecins spécialistes des maladies infectieuses, les professionnels de la lutte contre les infections et les laborantins y participeront de plusieurs façons. transiti sur, y compris les rapports de cas sur le Web et les rapports de laboratoire électroniques ELR Les rapports de cas basés sur le Web reproduisent essentiellement les cartes jaunes sur papier ou les rapports sur les cartes de morbidité. ELR est un concept moins connu, mais il a le potentiel améliorer la rapidité et l’exhaustivité de la CDR Cependant, la microbiologie, avec sa nomenclature en constante évolution et l’émergence de nouvelles espèces et sérotypes, crée des défis particuliers à toute tentative de systématisation et d’automatisation de la communication électronique. et les professionnels de laboratoire Parce que la médecine, la santé publique et la technologie de l’information sont des domaines riches en acronymes, un glossaire est fourni

Tableau Lexique de quelques acronymes utilisés en santé publique et technologies de l’information Acronyme Expansion HL Niveau de santé LIMS Système de gestion de l’information de laboratoire LOINC Logical Observation Identifiers Noms et codes NCMT Nationalement Notifiable Conditions NEDSS Système national de surveillance des maladies électroniques OBR Demande d’observation OBX Résultat d’observation PHIN Santé publique Réseau d’information PHIN MS Système d’information de santé publique PHLIS Système d’information de laboratoire de santé publique SFTP Protocole de transport sécurisé de fichier SNOMED Systématisé Nomenclature de médecine Acronyme Agrandissement HL Niveau de santé LIMS Système de gestion d’information de laboratoire LOINC Logique Observation Identificateurs Noms et codes NCMT Tableaux de cartographie NEDSS Système national de surveillance des maladies électroniques OBR Demande d’observation OBX Résultat de l’observation PHIN Réseau d’information sur la santé publique PHIN MS Santé publique Informer ation Système de messagerie réseau PHLIS Système d’information de laboratoire de santé publique SFTP Protocole de transport de fichiers sécurisé SNOMED Nomenclature de médecine systématisée Agrandir l’image

Rapport de laboratoire électronique

Au cours de la dernière décennie, certains laboratoires, en particulier des laboratoires de référence, ont transmis des résultats de laboratoire à grand volume, par exemple des résultats d’infections sexuellement transmissibles dans un format de fichier électronique, sur Internet ou sur un disque envoyé par courrier ordinaire. Département de la santé, il doit être ouvert et les données doivent être distribuées aux programmes et bases de données appropriés, soit électroniquement ou sur papier. Le système d’information du laboratoire de santé publique PHLIS du CDC est un MS-DOS Microsoft Système de surveillance de laboratoire basé sur le système; ERE est la messagerie directe et automatisée des informations de laboratoire de maladies à déclaration obligatoire provenant des systèmes de gestion de l’information de laboratoire clinique LIMS directement au système CDR de la juridiction de santé publique appropriée Lorsque le rapport arrive, un rapport de cas est créé alertée par le système CDR, un chercheur sur les maladies transmissibles est particulièrement utile dans les cas où le diagnostic peut être basé uniquement sur des résultats positifs de tests de laboratoire, par exemple, infection à Chlamydia et Salmonella et gonorrhée, entre autres syndrome de choc toxique, maladie de Lyme et Diverses catégories de syphilis, p. ex. congénitales, primaires et secondaires, nécessitent des données cliniques pour le diagnostic. La DRE peut être utilisée à d’autres fins de surveillance de la santé publique, notamment le nombre de cultures de grippe ordonnées pour détecter les éclosions au plus tôt. moment possible , et tracki la notification d’autres problèmes de santé publique liés à des maladies non transmissibles diagnostiquées en laboratoire, tels que le plomb , le mercure et l’intoxication au monoxyde de carbone; déclaration des maladies animales; Surveillance de l’alimentation, des médicaments et des produits laitiers L’objectif d’ELR est de minimiser l’effort humain requis pour signaler les cas et améliorer la rapidité et l’exhaustivité des rapports. L’exhaustivité renvoie à la fois aux informations fournies dans le rapport et à la proportion de cas diagnostiqués. moins de cas de maladies transmissibles sont signalés que ce qui est diagnostiqué dans le laboratoire de microbiologie Plusieurs études ont documenté que la CDR est plus rapide et plus complète avec ELR À Hawaii, la notification électronique des conditions a multiplié par nombre de rapports, qui sont parvenus à la juridiction de santé publique en moyenne quelques jours plus tôt que les rapports conventionnels Dans certaines études, les rapports électroniques étaient susceptibles d’avoir plus de champs complétés que les rapports papier .

Normes et rapports de laboratoire électronique

Pratiquement tout succès dans la transmission de données électroniques dépend de «l’interopérabilité», des définitions universellement partagées et des méthodes de transmission de l’information. Ce n’est pas un concept étranger pour les maladies infectieuses, qui comprennent l’importance élémentaire des définitions de cas. , la syntaxe de la structure «phrase», et les protocoles de messagerie la méthode de livraison sont particulièrement critiques pour la transmission électronique automatisée de données. La CDC est à l’avant-garde des cadres et normes de collecte, de maintenance, d’analyse et de diffusion électronique. Les efforts de la CCL en faveur du Système national de surveillance des maladies électroniques NEDSS – maintenant appelé initiative PHIN du Réseau d’information sur la santé publique – se sont concentrés sur le REC, fournissant un modèle pour l’architecture des bases de données, les normes de messagerie et de vocabulaire et le développement d’ar Système d’information Organisations professionnelles intéressées par l’amélioration de l’interface entre l’information sanitaire électronique et la santé publique, notamment l’Association nationale des organismes de santé municipaux et de comté, le Conseil d’État et les épidémiologistes territoriaux, l’American Public Health Laboratory Association , l’Association nationale pour les technologies de l’information en santé publique et l’Association nationale pour les statistiques de la santé publique et les systèmes d’information, ont également contribué à la progression d’ELR

Vocabulaire

La définition de «vocabulaire» dans ce contexte ne diffère pas de sa définition dans le dictionnaire Webster: un groupe de termes arrangés et définis Deux vocabulaires de soins de santé-LOINC Logical Observation Identifiers Noms et codes; Regenstrief Institute et SNOMED Systematized Nomenclature of Medicine; College of American Pathologists – ont été approuvés par le Département américain de la Santé et des Services humains et le CDC dans leurs efforts pour promouvoir des systèmes d’information santé et santé interopérables. LOINC est un catalogue exhaustif de tous les tests diagnostiques incluant la chimie, l’hématologie et la microbiologie Chaque test a été distingué par sa source, par exemple, sérum, expectoration ou selles, méthode, par exemple, ELISA, culture ou amplification de l’ADN, et le format dans lequel le résultat est représenté ordinairement [par ex. , positif ou négatif, présent ou absent], nominatif [nom d’un organisme], titre [eg::], ou quantitatif [eg, mg / dL] Le numéro de LOINC décrit un test, mais ne fournit pas le résultat de un test spécifiquePathologists ont été parmi les premiers médecins à reconnaître la nécessité d’une façon standardisée de nommer les résultats des tests Dans le milieu, les pathologistes ont commencé à systématiser les concepts de diagnostic SNOMED http: // wwwsnomedorg est allé SNOMED-CT ou SNOMED-Terminologie clinique SNOMED distingue les concepts pour la condition, par exemple, pertussis et l’organisme causal Bordetella pertussisLOINC et SNOMED se complètent mutuellement; le numéro LOINC décrit le test effectué, et le code SNOMED nomme le résultat. Ainsi, de manière simpliste, la combinaison LOINC / SNOMED est la même que «order / result» Par exemple, LOINC number – décrit un identifiant de concept SNOMED de culture hémisphérique décrit un résultat: Neisseria meningitidis Ensemble, ils décrivent une hémoculture positive pour N meningitidis Le même nombre de LOINC pourrait décrire une hémoculture avec un résultat différent, Brucella melitensis, par exemple, et un identifiant de concept SNOMED différent, un nombre de LOINC peut décrire un test spécifique à un organisme , comme un test pour un antigène spécifique Le résultat est rapporté comme « détecté » ou « non détecté », pour lequel il n’y a pas de concept SNOMED L’identificateur de concept SNOMED ne serait pas nécessaire, car le mot « detecté » nomme par réflexe le condition sur la base du numéro de LOINC Par exemple, le numéro de LOINC – décrit un test pour détecter l’ADN de Mycobacterium tuberculosis dans les expectorations, et il est effectué par p la suppression d’une cible amplifiée par PCR «positive», «présente» ou «détectée» peut apparaître dans la partie «résultat» d’un messageBien que LOINC et SNOMED soient les vocabulaires acceptés pour les essais cliniques et les rapports aux États-Unis et ailleurs Elles sont loin d’être idéales pour la santé publique et les ELR Elles ont toutes deux été développées initialement pour la facturation et le soin des patients, il y a redondance dans les nombres de LOINC parce que chaque laboratoire souhaite maintenir des codes «séparés mais égaux». Les efforts sont en cours pour modifier LOINC et SNOMED afin d’améliorer leur applicabilité en santé publique et d’encourager les vendeurs de LIMS à utiliser leur

« Mapping » vers LOINC et SNOMED: Tableaux de cartographie des conditions à déclaration obligatoire à l’échelle nationale

Comme noté ci-dessus, actuellement, peu de LIMS utilisent LOINC et SNOMED. Beaucoup de LIMS enregistrent la commande et le résultat d’un test de laboratoire en utilisant des codes alphanumériques locaux spécifiques à ce laboratoire ou à un fournisseur particulier. Les combinaisons de codes LOINC / SNOMED correspondent au test et au résultat local d’un laboratoire – un travail étonnamment complexe et fastidieux Le CDC a récemment publié les «Tableaux de cartographie des conditions à notification nationale» NCMT Ces tableaux succèdent aux tableaux de Dwyer. Les tableaux SNOMED sont associés aux mêmes maladies et affections à déclaration obligatoire. Ces tableaux servent de base pour la mise en correspondance des codes LIMS locaux avec les codes standard. En théorie, chaque routine microbiologique de routine peut être identifiée. culture décrite par un numéro LOINC dans un format qui inclut la source du spécimen, la méthodologie utilisée, et Dans la pratique, cependant, de nombreuses combinaisons ne sont pas possibles, par exemple, l’hémoculture et Treponema pallidum ou probablement, par exemple, la culture brûlure et N gonorrheae. seules les combinaisons possibles et probables et reportables sont incluses, le nombre d’entrées NCMT diminue de & gt ;, à ~

Syntaxe

En plus de s’entendre sur la signification des termes et des combinaisons ordre / résultat dans un message électronique, l’expéditeur habituellement le LIMS et le récepteur habituellement la base de données de santé publique doit se mettre d’accord sur l’ordre – la structure ou la syntaxe « phrase » dans laquelle ces termes sont transmis Un humain peut interpréter la signification d’une phrase désordonnée semblable à Yoda, par exemple, «marcher dans le parc, je le ferai», mais une machine ne peut pas l’organisation Health Level HL fournit les règles les plus largement acceptées pour la syntaxe des messages liés à la santé Un certain nombre d’organisations et de documents spécifient comment HL doit être utilisé dans la santé publique ELR Bien que complexe, les règles HL sont simples Les messages HL sont divisés en « segments », et chaque segment est divisé en « éléments » Chaque segment dans un ELR contient différentes parties du message, qui comprennent les caractéristiques démographiques du patient, des informations identifiant le laboratoire et le fournisseur de soins de santé qui commande. er peut apparaître dans un message HL Le segment de demande d’observation OBR est analogue à un formulaire de demande de laboratoire: «voici l’échantillon, s’il vous plaît faites ce test LOINC numéro» Le segment de résultat d’observation OBX rapporte les résultats du test. dans l’élément OBX, pour indiquer au récepteur quel test a été effectué. Le résultat réel du test est indiqué dans OBX par un identifiant SNOMED, ​​une valeur de résultat, par exemple « positive » ou « mg / dL », ou le nom de un organisme écrit et potentiellement mal orthographié de l’une des façons suivantes: «Staphylococcus aureus», «Staph aureus» ou «S aureus»

Protocoles de messagerie et sécurité

Une fois que la signification et la structure du message ont été normalisées, les parties émettrice et réceptrice doivent convenir de la manière dont le message sera envoyé, c’est-à-dire le «protocole de messagerie» ou le «protocole de transport». fax et l’expéditeur transmet le message via un transporteur pigeon, les parties ne communiquent pas En outre, le message doit être codé ou crypté, au cas où il est intercepté par une partie inappropriée Le protocole de transport de fichiers est généralement sélectionné sur la base de la Type d’envoi et de réception des systèmes d’information et niveau de sécurité souhaité Les options de sécurité pour ELR vont du protocole de transfert de fichiers sécurisé SFTP au système de messagerie du réseau d’information de santé publique proposé par la CDC PHIN MSDe sources de données à faible volume, les résultats quotidiens peuvent être en lots et transportés de nuit De grands volumes de grands hôpitaux ou de laboratoires de référence ou les laboratoires de santé publique de l’état, les RLE peuvent être transmis sous la forme de «messages» discrets et presque continus lorsque les rapports de résultats de laboratoire sont complétés, puis formatés en HL et transmis au système CDR du système de santé publique

La Loi sur la transférabilité et la responsabilité en matière d’assurance-maladie et la RLE

CDR est une activité légalement autorisée et requise dans tous les états et territoires. La HIPAA permet au fournisseur de services médicaux et / ou au département des dossiers médicaux ou au personnel du fournisseur de signaler les informations médicales d’un patient concernant une maladie transmissible, sans l’autorisation du patient. L’exemption HIPAA n’est pas affectée par la manière dont l’information est transférée ou conservée, par exemple, par voie électronique ou sur papier, par transmission automatique ou par manuel, bien que la HIPAA exige que une entité visée, comme un fournisseur, doit rendre compte de chaque divulgation d’informations de santé protégées sans l’autorisation du patient, la comptabilité simplifiée est explicitement autorisée pour les divulgations multiples dans le même but Selon la CDC et le ministère de la Santé et des Services sociaux, « Où l’identité couverte a, d Au cours de la période comptable, plusieurs divulgations à un même destinataire aux mêmes fins, la règle de confidentialité prévoit un mode de comptabilisation simplifié. Dans de tels cas, l’entité visée doit seulement identifier le destinataire de ces divulgations répétitives, le but de la divulgation, et décrire les RPS divulgués de façon routinière « Un SGIL qui est programmé pour transmettre automatiquement les résultats déclarables à une administration de santé publique spécifiée peut générer une liste quotidienne ou hebdomadaire de rapports à des fins comptables.

Obstacles à ELR et quelques solutions

De nombreux obstacles existent pour un RTE efficace. Ils comprennent, en premier lieu, le fait que de nombreux laboratoires cliniques n’ont pas de LIMS électronique. Parmi ceux qui le font, la plupart des LIMS n’utilisent pas LOINC, SNOMED et HL; ils utilisent plutôt des «codes locaux» ou pire, une combinaison de codes locaux et de texte libre pour indiquer le test commandé et son résultat. Dans de telles situations, les codes LIMS locaux doivent être «mappés» aux codes standards. compétence, les médecins des maladies infectieuses et les microbiologistes cliniques et les immunologistes peuvent participer à la corrélation des codes LIMS locaux avec les normes LOINC et SNOMED. En réalité, ELR inclut le «tamisage» automatique et continu des résultats de tous les laboratoires pour les résultats déclarables. Créer un enregistrement «test» réflexe pour chaque test produisant un résultat à déclarer. Des règles doivent être écrites pour identifier un résultat positif pour une maladie à déclaration obligatoire. Ce qui compte comme un résultat positif variera, selon la nature du test. le résultat de culture est à signaler si l’isolat est Neisseria meningitidis, mais pas si l’isolat est Enterobacter atory peut définir un seuil local pour les résultats positifs des tests sérologiques Lorsqu’un résultat reportable est identifié, un nouvel enregistrement – le test reportable: reflex – est créé Tous les tests à signaler: les enregistrements reflex sont envoyés au système d’information de la juridiction de santé publique et une copie Le dossier reflex n’est pas envoyé à l’hôpital ou au système d’information sur les soins de santé. Beaucoup de LIMS ne contiennent pas d’informations détaillées sur les caractéristiques démographiques du patient source, manquant d’informations de base telles que l’adresse du patient, est disponible dans le système d’information sur les soins de santé connexe, mais pas nécessairement dans le SGIL Bien que certaines études aient démontré que le RLE augmente le nombre de champs contenant des données , certains ont constaté que moins de champs sont complétés. système d’information sur les soins à inclure dans le RLE, mais cela nécessite plus de programmation; Par conséquent, ELR peut déplacer une partie du travail d’obtention des informations démographiques et épidémiologiques de base du laboratoire et des professionnels de la prévention des infections au personnel du département de santé lorsque de nouvelles méthodes d’essai, p. ex. Le mappage est une tâche permanente. Beaucoup de conditions nécessitent plus que des données de laboratoire pour répondre à une définition de cas. Cependant, un rapport de laboratoire électronique a été envoyé au système de santé publique. Le système CDR alertera un enquêteur sur les maladies transmissibles, qui ouvrira une enquête pour voir si le cas répond à la définition

Avantages pour les fournisseurs de soins de santé

Bien que les fournisseurs de soins de santé aient tardé à utiliser les dossiers de santé électroniques, ELR réduira finalement le fardeau de la paperasserie pour les fournisseurs et améliorera les rapports. Cependant, ELR peut exiger des laboratoires et des professionnels de la prévention des infections d’interagir de façon différente. responsabilité des rapports ELR réduira la paperasserie du laboratoire, et peut-être celle des professionnels du contrôle des infections, pour la soumission des informations de laboratoire sur les maladies déclarables. Elle fournira la documentation des rapports pour les registres internes et, si nécessaire, pour le respect des règles HIPAA. partager le rapport généré par son LIMS avec les professionnels de la prévention des infections et les fournisseurs de soins de santé appropriés, le laboratoire et les fournisseurs ne peuvent extraire des données – autres que les données qu’ils ont saisies – du système CDR. Ce serait analogue au microbiologiste et au fournisseur. service de santé et d’ouverture ses dossiers Les informations collectées dans une enquête sur une maladie transmissible ne sont pas un dossier clinique et n’appartiennent pas au clinicien ou au patient. De nombreux systèmes CDR «redonnent» en fournissant des données agrégées et géographiquement proches, en temps réel ou proches. , les données recueillies sur l’infection par le virus du Nil occidental ou la grippe aux cliniciens

Conclusion

Le CDR électronique, en raison de son mandat légal et de son importance évidente pour la santé publique, constitue une première étape importante dans le criblage et la mise en commun des données de santé à des fins autres que les soins aux patients. et facturation Bien qu’il soit difficile de développer un vocabulaire contrôlé pour la CDR automatisée en raison de la nature dynamique de la microbiologie, elle ouvrira la voie à la collecte d’autres informations essentielles à l’amélioration des soins de santé. ELR ne remplace pas le clinicien astucieux et l’épidémiologiste de santé publique. communication directe et immédiate entre le clinicien et le ministère de la Santé dans des situations préoccupantes. Elle ne remplace pas la responsabilité du clinicien de soumettre un rapport de cas contenant d’importantes informations démographiques et épidémiologiques. Cependant, ELR améliorera l’exhaustivité et la rapidité des rapports pour les résultats de laboratoire pour les rapports, tels que les maladies d’origine alimentaire, les maladies bactériennes invasives et les infections transmissibles sexuellement

Reconnaissance

Conflits d’intérêts potentiels RW et BC: pas de conflits